cbioportal-database

@jaechang-hits · 收录于 1 周前

Cancer genomics (TCGA et al.) via cBioPortal REST API. Retrieve somatic mutations, CNAs, expression, clinical data (survival/stage/treatment) across thousands of studies. Use for TMB, oncoprints, survival analysis. For population frequencies use gnomad-database; for drug-gene interactions use opentargets-database.

场景肿瘤研究基因分析生存分析

适合你，如果做癌症基因组学研究，需要从cBioPortal获取TCGA等数据

/ 下载安装

https://github.com/jaechang-hits/SciAgent-Skills/tree/main/skills/genomics-bioinformatics/databases/cbioportal-database ↗

/ 通过 npx 安装 校验哈希

npx oh-my-skill add jaechang-hits/sciagent-skills/cbioportal-database

/ 通过 bash 安装

curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- jaechang-hits/sciagent-skills/cbioportal-database

/ 已经装过?验证本机副本,不用重装

npx oh-my-skill verify jaechang-hits/sciagent-skills/cbioportal-database

安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。

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索引托管

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