jaspar-database
@jaechang-hits · 收录于 1 周前
JASPAR 2024 TF binding profiles via REST API and pyJASPAR. Retrieve PFMs/PWMs by TF name, JASPAR ID, species, or structural class. Scan DNA for TFBS; browse by taxon (human, mouse) or TF family (bHLH, zinc finger). Use for motif enrichment input, TFBS scanning, and regulatory sequence analysis. For ChIP-seq peak motif discovery use homer-motif-analysis; for regulatory variant scoring use regulomedb-database.
适合你，如果做转录因子结合位点预测或调控序列分析
/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add jaechang-hits/sciagent-skills/jaspar-database/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- jaechang-hits/sciagent-skills/jaspar-database/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify jaechang-hits/sciagent-skills/jaspar-database安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
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