star-rna-seq-aligner
@jaechang-hits · 收录于 1 周前
Splice-aware RNA-seq aligner producing sorted BAM and splice junction tables. Builds genome index, runs two-pass alignment for better junctions. Outputs sorted BAM, junctions (SJ.out.tab), stats (Log.final.out), optional gene counts. Use Salmon for fast pseudoalignment; STAR when a BAM is needed for variant calling, IGV, or ENCODE pipelines.
适合你，如果需要在RNA-seq流程中生成BAM文件用于变异检测或可视化。
/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add jaechang-hits/sciagent-skills/star-rna-seq-aligner/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- jaechang-hits/sciagent-skills/star-rna-seq-aligner/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify jaechang-hits/sciagent-skills/star-rna-seq-aligner安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
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