bioservices

@k-dense-ai · 收录于 1 周前 · 上游提交昨天

Unified Python interface to 40+ bioinformatics services. Use when querying multiple databases (UniProt, KEGG, ChEMBL, Reactome) in a single workflow with consistent API. Best for cross-database analysis, ID mapping across services. For quick single-database lookups use gget; for sequence/file manipulation use biopython.

场景跨库查询 id映射生物数据分析

适合你，如果需要在多个生物数据库间进行联合查询和ID映射

/ 下载安装

https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/tree/main/skills/bioservices ↗

/ 通过 npx 安装 校验哈希

npx oh-my-skill add k-dense-ai/scientific-agent-skills/bioservices

/ 通过 bash 安装

curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- k-dense-ai/scientific-agent-skills/bioservices

/ 已经装过?验证本机副本,不用重装

npx oh-my-skill verify k-dense-ai/scientific-agent-skills/bioservices

安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。

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怎么用

商店整理自技能原文 · 版本 3f825ca · 表述以原文为准

它做什么

安装后，Claude 可以帮你从 40 多个生物信息学数据库（如 UniProt、KEGG、ChEMBL）中查询和获取数据，还能跨数据库转换 ID、分析蛋白质、通路和化合物。

什么时候触发

当你需要同时查询多个生物数据库，或进行跨数据库的 ID 映射、通路分析时触发。

装好后可以这样说

会使用 UniChem 进行跨数据库 ID 转换。

需要先设置 NCBI_EMAIL 环境变量。

技能原文在 GitHub 查看 →

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