cellxgene-census
Query the CZ CELLxGENE Census programmatically for versioned public single-cell and spatial transcriptomics data. Use when you need population-scale cell metadata, gene expression slices, Census summary counts, source H5AD URIs/downloads, embeddings, spatial Census data, or reference atlas comparisons across organisms, tissues, diseases, assays, and cell types. For analyzing your own local single-cell data use scanpy, anndata, or scvi-tools.
适合你,如果你需要从CZ CELLxGene数据库获取版本化的单细胞和转录组数据
/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add k-dense-ai/scientific-agent-skills/cellxgene-census/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- k-dense-ai/scientific-agent-skills/cellxgene-census/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify k-dense-ai/scientific-agent-skills/cellxgene-census安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
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怎么用
商店整理自技能原文 · 版本 ab2f84a · 表述以原文为准它做什么
装上该技能后，Claude 能够通过 Python 代码查询 CZ CELLxGENE Census 数据库，获取公开的单细胞与空间转录组数据，包括细胞元数据、基因表达矩阵、数据集统计信息等，并返回分析结果。
什么时候触发
当您需要查询单细胞或空间转录组数据（如细胞类型、组织、疾病等特定条件下的基因表达或数据集信息）时触发。
装好后可以这样说
Claude会查询Census数据并返回结果。
Claude会获取并列出细胞类型列表。
Claude会跨物种查询并给出比较结果。
评论
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