deeptools
NGS analysis toolkit. BAM to bigWig conversion, QC (correlation, PCA, fingerprints), heatmaps/profiles (TSS, peaks), for ChIP-seq, RNA-seq, ATAC-seq visualization.
适合你,如果要做ChIP-seq、RNA-seq或ATAC-seq的数据处理与可视化
/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add k-dense-ai/scientific-agent-skills/deeptools/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- k-dense-ai/scientific-agent-skills/deeptools/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify k-dense-ai/scientific-agent-skills/deeptools安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
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怎么用
商店整理自技能原文 · 版本 3f825ca · 表述以原文为准它做什么
装上后,Claude 能帮你处理基因测序数据:把 BAM 文件转成 bigWig 格式、做质量控制(如相关性分析、PCA)、生成热图和谱图,用于 ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq 等实验的可视化。
什么时候触发
当你提到“BAM 转 bigWig”、“质量控制”、“热图”、“谱图”等关键词,或要求分析 ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq 数据时触发。
装好后可以这样说
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