etetoolkit
Analyze, manipulate, compare, annotate, and visualize phylogenetic or other hierarchical trees with ETE 4. Use for Newick/Nexus tree I/O, topology edits and pattern matching, Robinson-Foulds comparisons, gene-tree evolutionary events and reconciliation, NCBI/GTDB taxonomy, SmartView exploration, and publication rendering. Do not use it to infer trees from raw sequences; align sequences and infer a tree first.
适合你，如果处理系统发育数据并需要比较树结构。
/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add k-dense-ai/scientific-agent-skills/etetoolkit/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- k-dense-ai/scientific-agent-skills/etetoolkit/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify k-dense-ai/scientific-agent-skills/etetoolkit安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
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索引托管
怎么用
商店整理自技能原文 · 版本 ab2f84a · 表述以原文为准它做什么
安装后，Claude 可以用 ETE 4 工具包分析、操作、比较、注释和可视化系统发育树或其他层次树。支持读取 Newick/Nexus 格式，进行拓扑编辑、树比较、进化事件检测，以及整合 NCBI 分类信息并生成出版级图片。
什么时候触发
当用户需要处理 Newick/Nexus 树文件、比较树结构、检测基因树的进化事件，或者访问 NCBI 分类信息时触发。
装好后可以这样说
Claude 会加载树并输出统计信息。
Claude 会标注节点并返回 ortholog 分组。
Claude 会生成指定格式的树图。
评论
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