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etetoolkit

@k-dense-ai · 收录于 1 周前 · 上游提交 昨天

Phylogenetic tree toolkit (ETE). Tree manipulation (Newick/NHX), evolutionary event detection, orthology/paralogy, NCBI taxonomy, visualization (PDF/SVG), for phylogenomics.

适合你,如果做系统发育基因组学或进化生物学研究

/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add k-dense-ai/scientific-agent-skills/etetoolkit
/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- k-dense-ai/scientific-agent-skills/etetoolkit
/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify k-dense-ai/scientific-agent-skills/etetoolkit
安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
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怎么用

商店整理自技能原文 · 版本 3f825ca · 表述以原文为准
它做什么

装上后,Claude 可以帮你操作进化树:读取、修改、比较树结构,检测基因复制/分化事件,查询 NCBI 物种分类,并生成 PDF/SVG 格式的树图。

什么时候触发

当你上传或粘贴 Newick/PhyloXML 格式的树文件,或要求分析基因树、物种分类、可视化树图时触发。

装好后可以这样说
Claude 会加载树并输出叶子数、节点数等统计。
Claude 会运行进化事件检测,标记复制和分化节点。
Claude 会查询 NCBI 并给每个叶子添加分类信息。

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