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histolab

@k-dense-ai · 收录于 3 周前 · 上游提交 今天

Lightweight WSI tile extraction and preprocessing. Use for basic slide processing, tissue detection, tile extraction, and stain normalization for H&E images. Best for simple pipelines, dataset preparation, and quick tile-based analysis. For advanced spatial proteomics, multiplexed imaging, or deep learning pipelines use pathml.

适合你,如果经常需要处理H&E染色切片并提取组织块用于下游分析

/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add k-dense-ai/scientific-agent-skills/histolab
/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- k-dense-ai/scientific-agent-skills/histolab
/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify k-dense-ai/scientific-agent-skills/histolab
安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
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怎么用

商店整理自技能原文 · 版本 ab2f84a · 表述以原文为准
它做什么

Histolab能让Claude处理全切片图像(如SVS、TIFF),自动检测组织区域,提取小图块,并准备用于深度学习的数据集。还支持染色归一化。

什么时候触发

当用户需要处理H&E染色的全切片图像,进行组织检测、图块提取或染色归一化时触发。适合简单的数据处理和数据集准备。

装好后可以这样说
将输出512x512像素的图块到指定文件夹。
需要提供一张参考染色图像。
会覆盖所有组织区域。

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