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geo-connector

@ammawla · 收录于 3 周前

Search, query, and cross-reference NCBI GEO (Gene Expression Omnibus) datasets with ENCODE experiments. Use when the user wants to find GEO accessions for ENCODE experiments, search GEO for complementary datasets, download GEO metadata or series matrices, cross-reference ENCODE and GEO data, find supplementary files from GEO, or link GEO series to ENCODE experiments for provenance tracking. Also use when the user mentions GEO, GSE, GSM, GPL, GDS, series matrix, SOFT format, or needs to find expression data in GEO that complements their ENCODE analysis.

适合你,如果需要在GEO和ENCODE之间交叉查找基因表达数据

/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add ammawla/encode-toolkit/geo-connector
/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- ammawla/encode-toolkit/geo-connector
/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify ammawla/encode-toolkit/geo-connector
安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
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索引托管

怎么用

商店整理自技能原文 · 版本 b1d90bc · 表述以原文为准
它做什么

安装后,Claude 可以搜索 NCBI GEO 数据库,查找与 ENCODE 实验互补的数据集,下载 GEO 元数据和系列矩阵,并在 ENCODE 实验和 GEO 数据集之间建立交叉引用链接。

什么时候触发

当用户提到 GEO、GSE、GSM、GPL、GDS、系列矩阵、SOFT 格式,或需要查找与 ENCODE 分析互补的表达数据时触发。

装好后可以这样说
Claude 会搜索 GEO 中相关的系列并返回结果。
Claude 会从 GEO FTP 下载该系列的矩阵文件。

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