gtex-expression
@ammawla · 收录于 3 周前
Guide for integrating GTEx tissue expression data with ENCODE regulatory elements. Use when users need to check if a gene is expressed in a tissue, correlate regulatory elements with expression, or validate ENCODE findings against GTEx. Trigger on: GTEx, tissue expression, gene expression levels, expression atlas, eQTL, tissue-specific expression, TPM values.
适合你，如果需要在GTEx和ENCODE数据中验证基因表达与调控的关系。
/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add ammawla/encode-toolkit/gtex-expression/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- ammawla/encode-toolkit/gtex-expression/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify ammawla/encode-toolkit/gtex-expression安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
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怎么用
商店整理自技能原文 · 版本 b1d90bc · 表述以原文为准它做什么
装上后，Claude 能查询 GTEx 数据库中基因在 54 种人体组织中的表达量（TPM），并与 ENCODE 调控元件数据交叉验证，判断调控元件是否与基因表达一致。
什么时候触发
当用户提到 GTEx、组织表达、基因表达水平、eQTL、组织特异性表达、TPM 值等关键词，或要求验证 ENCODE 调控元件与基因表达的关系时触发。
装好后可以这样说
返回胰腺中 INS 基因的中位 TPM 值。
返回 SORT1 在肝脏及其他组织的表达数据。
返回与 INS 表达相关的遗传变异列表。
评论
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