histone-aggregation
@ammawla · 收录于 3 周前
Build comprehensive histone mark maps by aggregating narrowPeak data across multiple ENCODE experiments, donors, and labs. Use when the user wants to answer "where is this histone mark present in my tissue?" by combining peak calls from multiple studies into a union peak set with confidence annotations. Handles cross-lab batch effects, broad vs narrow marks, and ENCODE blocklist filtering.
适合你，如果需要在多个样本中定位组蛋白修饰的分布
/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add ammawla/encode-toolkit/histone-aggregation/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- ammawla/encode-toolkit/histone-aggregation/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify ammawla/encode-toolkit/histone-aggregation安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
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怎么用
商店整理自技能原文 · 版本 b1d90bc · 表述以原文为准它做什么
该技能会搜索并整合多个ENCODE实验的组蛋白ChIP-seq峰数据，生成一个合并的峰集，并标注每个峰在多少样本中出现，从而回答特定组织或细胞类型中某个组蛋白修饰的存在位置。
什么时候触发
当用户询问某个组蛋白修饰在特定组织中的位置，或要求合并多个实验的峰数据时触发。例如：“H3K27ac在胰腺中在哪里？”或“构建肝脏的组蛋白标记图谱”。
装好后可以这样说
技能会搜索并合并ENCODE实验，生成带置信度标注的峰集。
技能会聚合多个供体的峰数据，输出合并峰集。
评论
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