jaspar-motifs
@ammawla · 收录于 3 周前
Guide for using JASPAR transcription factor binding profiles with ENCODE ChIP-seq data. Use when users need to find TF binding motifs in ENCODE peaks, validate ChIP-seq targets with known motifs, or scan regulatory regions for TF binding potential. Trigger on: JASPAR, motif database, binding profile, PWM, position weight matrix, TF motif, motif enrichment, motif scanning, binding site prediction.
适合你，如果做转录因子结合位点分析或ChIP-seq数据验证
/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add ammawla/encode-toolkit/jaspar-motifs/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- ammawla/encode-toolkit/jaspar-motifs/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify ammawla/encode-toolkit/jaspar-motifs安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
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怎么用
商店整理自技能原文 · 版本 b1d90bc · 表述以原文为准它做什么
装上后，Claude 能帮你用 JASPAR 数据库中的转录因子结合图谱（PWM）分析 ENCODE 的 ChIP-seq 数据，验证目标转录因子是否直接结合 DNA，发现共结合因子，并评估变异对结合位点的影响。
什么时候触发
当你需要验证 ENCODE ChIP-seq 峰中的转录因子结合基序、扫描调控区域寻找潜在结合位点，或评估变异对基序的影响时触发。
装好后可以这样说
Claude 会指导你使用 FIMO 扫描并分析间距。
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