liftover-coordinates

@ammawla · 收录于 1 周前

Convert genomic coordinates between assembly versions (GRCh37/hg19 to GRCh38/hg38, mm9 to mm10). Guides UCSC liftOver for BED files, CrossMap for VCF/bigWig, and handles unmapped regions with provenance logging.

场景基因组分析数据迁移

适合你，如果经常处理不同版本的人类或小鼠基因组数据

/ 下载安装

https://github.com/ammawla/encode-toolkit/tree/main/plugin/skills/liftover-coordinates ↗

/ 通过 npx 安装 校验哈希

npx oh-my-skill add ammawla/encode-toolkit/liftover-coordinates

/ 通过 bash 安装

curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- ammawla/encode-toolkit/liftover-coordinates

/ 已经装过?验证本机副本,不用重装

npx oh-my-skill verify ammawla/encode-toolkit/liftover-coordinates

安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。

37GitHub stars

~4.8K最小装载

~4.8K含声明引用

~6.1K文本包总量

索引托管

登录即可评论;带「已验证安装」的,是发布者名下有本店的安装或持有记录。

…