pipeline-hic
@ammawla · 收录于 1 周前
Execute ENCODE Hi-C pipeline from FASTQ to contact matrices and loop calls. Child of pipeline-guide. Provides Nextflow execution with Docker and cloud deployment. Use when processing Hi-C data, generating contact matrices, calling loops or TADs. Trigger on: Hi-C pipeline, chromatin conformation, contact matrix, loop calling, TAD detection, Juicer, HiCCUPS, 3D genome.
适合你，如果正在处理Hi-C数据并需要标准化的分析流程
/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add ammawla/encode-toolkit/pipeline-hic/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- ammawla/encode-toolkit/pipeline-hic/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify ammawla/encode-toolkit/pipeline-hic安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
37GitHub stars
~3.1K最小装载
~3.1K含声明引用
~9K文本包总量
索引托管
评论
登录即可评论;带「已验证安装」的,是发布者名下有本店的安装或持有记录。
…